Korzeń kobylaka jest stosowany leczniczo w biegunkach różnego pochodzenia, w stanach nieżytowych żołądka, jelita cienkiego i grubego, w infekcji bakteryjnej, nadmiernej fermentacji, wzdęciach, zatruciach pokarmowych. Jedną łyżeczkę korzenia należy zalać szklanką wrzątku i pozostawić pod przykryciem do zaparzenia na około 10-15 minut.